2020/10/25

COVID-19 東京都の感染者数プロファイルの解析 [10月25日]

COVID-19 東京都の感染者数プロファイルの解析 [10月25日]

Profile analyses of COVID-19 affected numbers in Tokyo [October 25th, 2020]

 
東京都が本日10月25日に発表した感染者数は124名で,ここ2週間を取り込んだ解析では,減少の兆しが表れているように見えます。

前回のブログ(9月11日)に記載した"東京都の感染指数プロファイルの解析"で指摘した傾向が続いています。第2波を3つロジステック関数を用いてプロファイルを解析し,最新日のものとしました。

図1に,日別の感染者数(日別obs),その7日間移動平均値(日別ave),本ブログの解析による日別の感染者数の計算値(日別calc),そして"再生産率"を挙げます。第2波の主要なピークの計算値は7月23日に記した"COVID-19 感染者数プロファイルの計算モデルと見方"のプロファイルとほぼ同じです。
 
図1. 10月25日発表の東京都の確定日別データ(10月24日まで)に基づいています [図をクリックすると拡大]

図1の"再生産率"は"実効再生産数"に相当する値で,1よりも大きければ大きいほど感染は拡大し,1よりも小さければ小さいほど収束に向かう傾向が大きくなります。

再生産率は,9月4日頃に1.0を超えて(感染者数では底)増え,以降は1.0+/-0.08の範囲にありましたが。直近では0.80になりました。図1の"日別ave"と図2の"τ×平均"を見ると,計算値が実際を追随しているように見受けられます。この1月間余り続いた1近い値からようやく減少し始めたようです。

第2波の主要なプロファイル(日別感染者数はD f1 calc),"第2+β波"のプロファイル(D f2 calc)に"第2+γ波"のプロファイル(D f3 calc)も計算に含め,これらを合成した計算値(日別calc)を図1と図2に示しています。感染者数の累計値(累計obs')に計算値を最適化した結果(累計calc')は図2に示してあります(最新の累計感染者数で除して最大値が1となるように規格化した値です)。

図2. 東京都の感染者数プロファイルの最適化の詳細 [クリックで拡大]
 
図2に東京都の感染者数プロファイルの詳細を示します。第2波についての"τ×平均"と"τ×増加率"は,第2+β波と第2+γ波を組み込んだものです。τ×平均は実質的な増加率であり,最適化で得られるτ×増加率を追随しています。ただ,10月に入っての先週の変化はまだ追随しきれていない,あるいは,変化が過度的なものかもしれません。
 
第1波の環境収容力(プロファイル全体の累計感染者数)は5,090,主要な第2波の環境収容力は16,930,"第2+β波"の環境収容力は1,800となりました。"第2+γ波"の変曲点(ピーク)は10月12日,環境収容力は8,980,基本再生産数相当値は1.5で主要な第2波とほぼ同じです。

"第2波"と"第2+β波"は既に収束し,現在は"第2+γ波"が大部分を占めています(図2)。"第2+β波"と"第2+γ波"はこれまでに8,080の累計感染者を生じ,既に第1波をはるかに凌いでいます。この2つのプロファイルを合わせると,10,800の累計感染者数が見込まれ,第1波の2倍を超える大きな数です。"第2+γ波"を第3波と呼んだほうが適切かもしれません。

図の見方は,以下,あるいは,COVID-19 感染者数プロファイルの計算モデルと見方"をご覧ください。

グラフの見方


感染確定日データの日別の感染者数の累計が,"累計obs"です。ただし,最新の値で割って,最大値が1となるようにした"累計obs'"をグラフにプロットしています。

累計obsに合致するようにロジスティック関数を最適化し,最適化した関数による計算値が"累計calc"です。この値を最新の累計obsで割った"累計obs'"と"累計calc'"をプロットしています。最新の"累計obs'"は1です。

"日別obs"は,日別の感染者数です。最適化した関数から計算される日別の感染者数が"日別calc"です。

最適化した関数から計算される内的自然増加率 r から計算される実効再生産数が,"τ×増加率"です。ここでの τ (tau) は,感染者が感染させてしまう平均日数で,値は7を採用しています。初期の頃の"τ×増加率"に1を加えた数が基本再生産数に対応すると考えられ,東京都の第1波では2,第2波では1.55程度です。

日別の感染者数から見積もることができる"τ×増加率"に相当する値について,素のデータが曜日ごとのばらつきが大きいため,7日間の移動平均をとった値が"τ×平均"です。第1波について"τ×平均1",第2波について"τ×平均2"としています。最新の3日間では7日間移動平均が適用できませんが,動向を把握するために,最新日は実際の値そのもの,前日では3日間の,前々日では5日間の移動平均を採用しています。そのため,最新日と前日の値の変動の幅は大きくなっています。

これら"τ×平均"は関数モデルが妥当ならば,"τ×増加率"に次第に合致するはずです。"τ×平均1"は第1波の"τ×増加率"によく沿っていて,"τ×平均2"は変化しながらも第2波の"τ×増加率"に追随しています。

"累計calc'""日別calc""τ×増加率"は日付を指定すれば計算できるので,数日後の値もプロットしています。

日別感染者数がピークに達するとき,"日別calc""τ×増加率"は変曲点に来ます。変曲点に来ると"τ×増加率"が初めのころの値の1/2となります。"τ×増加率""τ×平均"が次第に小さくなって,半分となる時期が感染のピークです。このときの累計感染者数を2倍すると,最大値になります。

"日別calc"はピークを挟んでグラフでは左右対称となります(偶関数です)。ピークの前と後では日別感染者数,および,その累計値(こちらは奇関数)はほとんど同じ値になります。


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